DEAE 蛋白純化系統可用于分離膜蛋白、酶、動物、植物和細菌的受體，還可以替換一些分離方法如硫酸銨分級法作為純化蛋白的*步，與色譜方法聯用。另外，DEAE 蛋白純化系統已經可以實現大規模操縱。固然使用離心分離器可以使大規模連續進行，但商品離心分離器用于效率和容量仍需進一步研究。而且，他們發現相分離操縱受細胞培養時產生的表面活性物質影響較大，體系兩相間密度差較小，表面張力較小，含產物的表面活性劑相的流變學行為較復雜，操縱較難。

DEAE 蛋白純化系統選擇性沉淀法

根據各種蛋白質在不同物理化學因子作用下穩定性不同的特點，用適當的選擇性沉淀法，即可使雜蛋白變性沉淀，而欲分離的有效成分則存在于溶液中，從而達到純化有效成分的目的。

1、吸附柱層析

吸附柱層析是以固體吸附劑為固定相，以有機溶劑或緩沖液為流動相構成柱的一種層析方法。

 

2、薄層層析

薄層層析是以涂布于玻板或滌綸片等載體上的基質為固定相，以液體為流動相的一種層析方法。這種層析方法是把吸附劑等物質涂布于載體上形成薄層，然后按紙層析操作進行展層。

 

3、聚酰胺薄膜層析

聚酰胺對極性物質的吸附作用是由于它能和被分離物之間形成氫鍵。這種氫鍵的強弱就決定了被分離物與聚酰胺薄膜之間吸附能力的大小。層析時，展層劑與被分離物在聚酰胺膜表面競爭形成氫鍵。因此選擇適當的展層劑使分離在聚酰胺膜表面發生吸附、解吸附、再吸附、再解吸附的連續過程，就能導致分離物質達到分離目的。